学校拥有52支运动队,曾经诞生过6位联赛冠军。该校为学生开设了20种体育运动项目,其中包括棒球、田径、越野、游泳、足球、篮球、橄榄球、垒球、曲棍球、网球、冰球、高尔夫球。学生社团活动包括社区服务社、辩论社、DJ俱乐部、戏剧社、商业领导社、摄影社、学生政府、武术社、国家荣誉组织、Operation Smile、MSG Varsity、Gael Winds 新闻社等。在2009-2012年度高校戏剧节中,由约翰肯尼迪天主高中学生编排的音乐剧Fiddler on the Roof获得了6项奖项提名,并最终获得最佳舞蹈表演奖和技术成就奖两项荣誉。约翰肯尼迪天主高中的工作室艺术社团是8届纽约州高校艺术联盟奖项得主,这个社团还是国家艺术组织、国家艺术荣誉组织成员,获得了纽约州艺术优秀奖。
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